bench: use of Eigen/Array is deprecated + fix includes for iostream

bench/basicbench.cxxlist

@@ -4,18 +4,25 @@
 # CLIST[((g++))]="g++-3.4 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
 
 # CLIST[((g++))]="g++-4.1 -O3 -DNDEBUG"
-CLIST[((g++))]="g++-4.1 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
+#CLIST[((g++))]="g++-4.1 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
 
 # CLIST[((g++))]="g++-4.2 -O3 -DNDEBUG"
-CLIST[((g++))]="g++-4.2 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
+#CLIST[((g++))]="g++-4.2 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
 # CLIST[((g++))]="g++-4.2 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000 -fprofile-generate"
 # CLIST[((g++))]="g++-4.2 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000 -fprofile-use"
 
 # CLIST[((g++))]="g++-4.3 -O3 -DNDEBUG"
-CLIST[((g++))]="g++-4.3 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
+#CLIST[((g++))]="g++-4.3 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000"
 # CLIST[((g++))]="g++-4.3 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000 -fprofile-generate"
 # CLIST[((g++))]="g++-4.3 -O3 -DNDEBUG -finline-limit=20000 -fprofile-use"
 
-# CLIST[((g++))]="icpc -fast -DNDEBUG -fno-exceptions -no-inline-max-size"
 # CLIST[((g++))]="icpc -fast -DNDEBUG -fno-exceptions -no-inline-max-size -prof-genx"
-# CLIST[((g++))]="icpc -fast -DNDEBUG -fno-exceptions -no-inline-max-size -prof-use"
+# CLIST[((g++))]="icpc -fast -DNDEBUG -fno-exceptions -no-inline-max-size -prof-use"
+
+#CLIST[((g++))]="/opt/intel/Compiler/11.1/072/bin/intel64/icpc -fast -DNDEBUG -fno-exceptions -no-inline-max-size -lrt"
+CLIST[((g++))]="/home/orzel/svn/llvm/Release/bin/clang++ -O3 -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -lrt"
+CLIST[((g++))]="/home/orzel/svn/llvm/Release/bin/clang++ -O3 -DNDEBUG -lrt"
+CLIST[((g++))]="g++-4.4.4 -O3 -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -lrt"
+CLIST[((g++))]="g++-4.4.4 -O3 -DNDEBUG -lrt"
+CLIST[((g++))]="g++-4.5.0 -O3 -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -lrt"
+CLIST[((g++))]="g++-4.5.0 -O3 -DNDEBUG -lrt"

bench/basicbenchmark.cpp

@@ -1,4 +1,5 @@
 
+#include <iostream>
 #include "BenchUtil.h"
 #include "basicbenchmark.h"
 

bench/benchBlasGemm.cpp

@@ -7,7 +7,8 @@
 // #define EIGEN_DEFAULT_TO_ROW_MAJOR
 #define _FLOAT
 
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+
 #include <Eigen/Core>
 #include "BenchTimer.h"
 

bench/benchCholesky.cpp

@@ -8,7 +8,9 @@
 //  -DTRIES=10
 //  -DSCALAR=double
 
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+
+#include <Eigen/Core>
 #include <Eigen/Cholesky>
 #include <bench/BenchUtil.h>
 using namespace Eigen;

bench/benchEigenSolver.cpp

@@ -9,7 +9,9 @@
 //  -DTRIES=10
 //  -DSCALAR=double
 
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+
+#include <Eigen/Core>
 #include <Eigen/QR>
 #include <bench/BenchUtil.h>
 using namespace Eigen;

bench/benchFFT.cpp

@@ -22,6 +22,8 @@
 // License and a copy of the GNU General Public License along with
 // Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
 
+#include <iostream>
+
 #include <bench/BenchUtil.h>
 #include <complex>
 #include <vector>

bench/benchVecAdd.cpp

@@ -1,4 +1,5 @@
 
+#include <iostream>
 #include <Eigen/Core>
 #include <bench/BenchTimer.h>
 using namespace Eigen;

bench/bench_norm.cpp

@@ -1,5 +1,6 @@
 #include <typeinfo>
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+#include <Eigen/Core>
 #include "BenchTimer.h"
 using namespace Eigen;
 using namespace std;

bench/bench_reverse.cpp

@@ -1,5 +1,6 @@
 
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+#include <Eigen/Core>
 #include <bench/BenchUtil.h>
 using namespace Eigen;
 

bench/bench_sum.cpp

@@ -1,3 +1,4 @@
+#include <iostream>
 #include <Eigen/Core>
 using namespace Eigen;
 using namespace std;

bench/benchmark.cpp

@@ -1,5 +1,8 @@
 // g++ -O3 -DNDEBUG -DMATSIZE=<x> benchmark.cpp -o benchmark && time ./benchmark
-#include <Eigen/Array>
+
+#include <iostream>
+
+#include <Eigen/Core>
 
 #ifndef MATSIZE
 #define MATSIZE 3

bench/benchmarkSlice.cpp

@@ -1,6 +1,8 @@
 // g++ -O3 -DNDEBUG benchmarkX.cpp -o benchmarkX && time ./benchmarkX
 
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+
+#include <Eigen/Core>
 
 using namespace std;
 using namespace Eigen;

bench/benchmarkX.cpp

@@ -1,4 +1,7 @@
 // g++ -fopenmp -I .. -O3 -DNDEBUG -finline-limit=1000 benchmarkX.cpp -o b && time ./b
+
+#include <iostream>
+
 #include <Eigen/Core>
 
 using namespace std;

bench/benchmarkXcwise.cpp

@@ -1,5 +1,6 @@
 // g++ -O3 -DNDEBUG benchmarkX.cpp -o benchmarkX && time ./benchmarkX
 
+#include <iostream>
 #include <Eigen/Core>
 
 using namespace std;

bench/quat_slerp.cpp

@@ -1,4 +1,5 @@
 
+#include <iostream>
 #include <Eigen/Geometry>
 #include <bench/BenchTimer.h>
 using namespace Eigen;
@@ -242,4 +243,5 @@ int main()
   BENCH(slerp_legacy_nlerp);
   BENCH(slerp_rw);
   BENCH(slerp_gael);
-}
+}
+

bench/sparse_cholesky.cpp

@@ -1,5 +1,6 @@
 // #define EIGEN_TAUCS_SUPPORT
 // #define EIGEN_CHOLMOD_SUPPORT
+#include <iostream>
 #include <Eigen/Sparse>
 
 // g++ -DSIZE=10000 -DDENSITY=0.001  sparse_cholesky.cpp -I.. -DDENSEMATRI -O3 -g0 -DNDEBUG   -DNBTRIES=1 -I /home/gael/Coding/LinearAlgebra/taucs_full/src/ -I/home/gael/Coding/LinearAlgebra/taucs_full/build/linux/  -L/home/gael/Coding/LinearAlgebra/taucs_full/lib/linux/ -ltaucs /home/gael/Coding/LinearAlgebra/GotoBLAS/libgoto.a -lpthread -I /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/CHOLMOD/Include/ $CHOLLIB -I /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/UFconfig/ /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/CCOLAMD/Lib/libccolamd.a   /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/CHOLMOD/Lib/libcholmod.a -lmetis /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/AMD/Lib/libamd.a  /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/CAMD/Lib/libcamd.a   /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/CCOLAMD/Lib/libccolamd.a  /home/gael/Coding/LinearAlgebra/SuiteSparse/COLAMD/Lib/libcolamd.a -llapack && ./a.out

bench/vdw_new.cpp

@@ -1,4 +1,5 @@
-#include <Eigen/Array>
+#include <iostream>
+#include <Eigen/Core>
 
 using namespace Eigen;